通过各种技术手段或社会分工协作，对厕所所收集的粪污进行就地处理或异地处理，使粪污无害化后再回归于环境。在进行粪污处理时，往往会带来一些附加的好处，例如回收了粪污中的有用成份用于制药、制肥或回收水资源。
减少了厕所对外界资源的依赖性，并节省资源，一般生态厕所具备粪便处理回收水的功能，也有一些厕所不使用水冲方式而达到洁净目的。还有一些厕所利用太阳能作为取暖能源。这些厕所在使用上更具有独立性，特别是对水资源的需求减少，从而具备了节水特点。
移动厕所生态环保移动厕所的特点是排污少，专家指出：人体排泄物中含有大量的病毒细菌。传统虹吸弯排污便器在冲水时，便器内的气旋可将病菌或微生物带到6米高的空中，并悬浮在空气中长达几个小时。在排污时存在回流残殖现象，（水封水中含有微量的粪便，）这些不洁净的水长时间存放会污染室内环境，影响健康。节水防臭环保移动厕所及设备，采用发泡液封堵直接排放方式。直接从污染源治理，做到了彻底治污。节水防臭环保移动厕所使粪便在泡沫中滑落进粪池后，定时直接清理回收。经过厌氧处理，杀灭了病菌和虫卵后形成高效农用优质有肥。